Uno de los métodos de control más promisorios de la pudrición carbonosa en el cultivo de caraota (Phaseolus vulgaris L.),causada por Macrophomina phaseolina (Tassi) Goid., es el uso del control biológico con Trichoderma spp. Es por ello que el objetivo de esta investigación fue evaluar la capacidad antagónica in vitro de aislados de Trichoderma spp., con respecto a M. phaseolina y a su vez caracterizar molecularmente mediante marcadores de ADN polimórfico amplificado al azar (RAPD) aislados de Trichoderma. En Venezuela, la información disponible con relación a la caracterización molecular y estudios de diversidad de aislamientos de Trichoderma es muy escasa, por tanto esta investigación constituye un aporte significativo en el conocimiento de las especies autóctonas de Trichoderma, escasamente estudiadas hasta ahora, y una innovación útil si se quiere profundizar en el conocimiento molecular detallado de las mismas.