La cuenca del río Atulapa, se localiza en el Corredor Seco de la región Centroamericana, que por sus diferencias altitudinales y biofísicas es una de las principales fuentes de agua que tributa al río Olopa en la República de Guatemala, parte alta de la cuenca del río Lempa de gran importancia para la República de El Salvador y Honduras. La cuenca del río Atulapa es de interés Trinacional, en la Reserva de la Biosfera “La Fraternidad”. El modelo utilizado para el análisis del Balance Hídrico Superficial en el suelo para la presente investigación, fue el algoritmo de Thornthwaite y Mather, se programó mediante un script en lenguaje Python, para utilizarlo como aplicación de un sistema de información geográfica, convirtiendo el algoritmo unidimensional en un análisis geoespacial tridimensional. El modelo permite evaluar la simulación de diferentes escenarios prospectivos, con variables de respuesta sobre el comportamiento del balance hídrico en el suelo como: La evapotranspiración real y potencial, comportamiento en los almacenamientos de agua en el suelo, excedentes y déficit de humedad en el suelo.