Diversas investigaciones en la región concluyen acerca de la modulación que ejerce el ENOS en los patrones de precipitación y consecuentemente, en los caudales de los ríos. Las épocas de sequías con niveles del río por debajo de lo normal se han relacionado con episodios de La Niña y las grandes crecidas del río Paraguay en los años 1988, 1992/93, son atribuidas a intensas señales de El Niño. Sin mencionar los reportes en los últimos meses de 2014 sobre de la manifestación de El Niño y la preocupación del desborde del río, que finalmente afectó en gran manera a la población ribereña en la capital y en otras zonas del país, con numerosas familias damnificadas.