La IPS Clínica San Rafael en los últimos cinco años ha presentado un gran crecimiento, desde sus inicios, en el año 2010 hace apertura con su sede principal en el barrio Cuba de la ciudad de Pereira, así lo demuestra la apertura de su sede en el centro de especialistas Megacentro Pinares en el año 2016 que es referenciada como centro de atención de alta complejidad. Debido a la serie de restructuraciones que se han ido presentando a lo largo del tiempo, han generado drásticas consecuencias en algunas áreas de la organización, un ejemplo de ello es que desde que se abrió la sede de Megacentro; la sede principal de Cuba ha sido descuidada, en su mantenimiento y modernización de su edificación situación que a la vista no se encuentra en las mejores condiciones, lo que genera que el cliente interno, haya presentados indicios no determinados de inconformidad por no poder generar un buen servicio a los usuarios.