La infección oculta por virus de la Hepatitis B (IOB) se caracteriza por la presencia en suero o plasma del genoma viral (ADN-VHB) y anticuerpos contra la proteína de la cápside (anti-HBc) en ausencia del antígeno de superficie (HBsAg). Para caracterizar la presencia de IOB en hijos de madres HBsAg(+), se estudiaron 291 muestras de niños HBsAg(-) y anti-HBs <50UI/L. Se determinó la exposición al virus (anti-HBc), a los sueros anti-HBc(+) se les realizó Reacción en Cadena de la Polimerasa en Tiempo Real (RCP-TR) para detectar ADN-VHB. La prevalencia de exposición al VHB (anti-HBc) en la población estudiada fue 16,8% (49/291). El ADN viral se cuantificó en el 14% (6/43) de los casos, observándose cargas virales entre 2,15 x 101 hasta 3,42 x 101 UI/mL. No hubó asociación significativa entre las variables sociodemográficas analizadas como edad, sexo y provincia de procedencia. La prevalencia de IOB es baja, las implicaciones clínicas y epidemiológicas de esta entidad, requiere de un monitoreo y atención a estos pacientes. Este estudio se realiza por primera vez en Cuba y aporta conocimientos para el diagnóstico, prevención y control de esta enfermedad en niños.