El glifosato es el herbicida empleado en el plan Colombia desde el año 2001, para la erradicación de los cultivos de amapola. Estas fumigaciones constantes realizadas específicamente al norte de Santander pueden afectar a los ríos Zulia y Tarra los cuales desembocan directamente en el río Catatumbo. Por esta razón se consideró necesario evaluar niveles residuales de glifosato en muestras de aguas y sedimento del río Catatumbo. Para la determinación de glifosato en agua, se aplicó un método basado en un proceso de limpieza. Los compuestos orgánicos en las muestras de agua fueron extraídos con diclorometano, la misma fue concentrada por evaporación con rotavapor. La extracción del glifosato en sedimento fue realizado por una técnica de equilibrio. La determinación de glifosato en sedimento se realizó sin derivatizarlo. El glifosato fue recuperado del sedimento por extracciones consecutivas con 0,5 M de NH4OH. La cuantificación para la determinación de glifosato en agua y sedimento del río Catatumbo se realizó por cromatografía iónica con un detector de conductividad.