Se estudió la variación en características de frutos y semillas de siete poblaciones de chile silvestre de Sinaloa, México con la intención de determinar la distribución de la variación entre y dentro de las poblaciones. Adicionalmente, se estimó la distribución de la variación entre plantas y dentro de plantas en las poblaciones. Para la característica peso de semillas, se estimó la variación dentro de frutos. Se hizo análisis de correlación entre todas las características, pero se puso atención especial a las características número y peso de semillas, para explorar la propuesta de que existe un compromiso entre ambos caracteres. En la mayoría de las características medidas, la mayor parte de la variación se presentó entre plantas dentro de poblaciones y años. Estos resultados demuestran que los parientes silvestres de chile tienen elevados niveles de variación entre y dentro de las poblaciones en los caracteres reproductivos relacionados con los frutos y semillas, y por tanto son un importante recurso genético que debemos seguir estudiando para mejorar su uso y conservación, ya que ha sido poco estudiado y amenazado por la deforestación y explotación a causa del ser humano.