El área norte de Puerto Rico tiene una gran variedad de playas que muestran características diversas. Estudiamos los hongos filamentosos que son patógenos al ser humano y se encuentran en la zona seca de la arena de las playas de Vega Baja, Manatí, Barceloneta y Arecibo. El crecimiento de colonias fluctuó de 3 UFC/g a 31 UFC/g. La arena de las playas se clasificó como calidad promedio utilizando los parámetros previamente establecidos. Se identificaron 104 especies de hongos mediante análisis molecular y 25 especies en el análisis de taxonomía tradicional. Utilizando la taxonomía tradicional se encontraron 6 géneros: Aspergillus, Penicillium, Rhizopus, Trichoderma, Hortaea y Fusarium. Las especies de mayor abundancia en el análisis molecular fueron: Aspergillus penicillioides, Aspergillus terreus, Microascus sp., Arthrographis kalrae, Paramicrosporidium sp., Dokmaia sp., Gliomastix polychroma y Aspergillus sp. Como hallazgo significativo, se identificaron 66 especies de nuevos registros para Puerto Rico. Muchos de los hongos identificados en este estudio son patógenos.