Se realizó un estudio comparativo de los caracteres anatómicos-morfológicos y bioquímicos de plantas de henequén provenientes de la micropropagación y de las propagadas convencionalmente, bajo condiciones de vivero. Se realizaron diferentes muestreos para caracterizar la epidermis por las caras adaxial y abaxial y el mesófilo de la hoja. Se evaluó la oscilación diurna de la acidez titulable, el contenido de azúcares reductores (mg/ml) y carbohidratos totales (mg/ml), determinándose la dinámica de la altura de la planta, el número de hojas, el área foliar y el comportamiento de la supervivencia. La epidermis resultó ser del tipo anfiestomática con estomas tetracíticos en los que ocurre primeramente la formación de células anexas y posteriormente las oclusivas, lo cual constituye el primer reporte para esta especie. La calidad del material de plantación se favorece con la combinación de la propagación biotecnológica que transmite el rejuvenecimiento del material vegetal y con la convencional que garantiza el robustecimiento. La altura óptima para el transplante a plantación comercial fue a los 15 meses.