Desde hace 150 años, el estudio de la vida microbiana marina ha evolucionado de una manera sorprendente. Iniciando con el aislamiento de bacterias marinas, y el establecimiento de su importancia en ambientes marinos, así como el papel que desempeñan en los ciclos del carbono y los nutrientes. Aunque se ha mejorado la metodología tradicional para investigar a estos microorganismos, los avances en las técnicas moleculares han permitido el estudio de una diversidad más certera y por lo tanto, el descubrimiento de una mayor fuente de productos naturales. El estudiar en conjunto la diversidad microbiana no dependiente de cultivo y el diseño adecuado de cebadores, ayuda a diseñar un mejor proyecto de investigación que garantice resultados satisfactorios. Los métodos tradicionales de cultivo no deben ser reemplazados, ni ser considerados inapropiados para los estudios de diversidad y búsqueda de nuevas sustancias bioactivas, ya que al conocer previamente la diversidad microbiana presente en determinado tipo de muestra, el investigador puede inferir el tipo de compuestos químicos que podrían estar presentes en la muestra.