En este trabajo de investigación, ganador del Premio Cátedra Hunosa, edición 2010, se afronta el desarrollo metodológico para la estimación de la capacidad de almacenamiento geológico regional de CO2 con el fin de permitir una cubicación a corto plazo de dicha capacidad total disponible en formaciones permeables profundas. La metodología desarrollada se basa en la utilización de los sistemas de información geográficas como herramienta de captura, almacenamiento, gestión, análisis y representación de datos georreferenciados, con capacidad para crear modelos con las variables implicadas en la estimación de la capacidad de almacenamiento de CO2. Se realiza un análisis de las incertidumbres asociadas que surgen en el transcurso del proceso de estimación de dicha capacidad, lo que permite poder clasificar por orden de importancia las mismas y poder así dirigir los esfuerzos de caracterización necesarios para reducir las incertidumbres en las estimaciones. Dicha metodología constituye un marco apropiado para el desarrollo de los modelos de estimación de dicha capacidad, puesto que permite integrar de manera sistemática toda la información existente y la actualización del conocimiento.