Las actividades antrópicas como deforestación, expansión de la frontera agrícola y actividades de construcción que se han desarrollado sobre este ecosistema, generan una fuerte presión sobre los recursos naturales y esto conlleva a la pérdida de su biodiversidad. Para el estudio sobre la evaluación del estado de conservación de la flora del matorral seco montano en el Valle del Chota se seleccionaron las comunidades de El Chota, San Alfonso, Carpuela, Juncal y Pusir Chiquito para realizar los muestreos y determinar la diversidad existente de esta zona.