En el presente trabajo se llevó a cabo una investigación para conocer la asociación que existe entre la calidad del aire interior con las quejas /síntomas de los ocupantes de un edificio de oficinas, ocupado por 390 personas que ahí laboran. Se analizaron las condiciones; Físicas (Humedad relativa, Temperatura, Iluminación), Químicas (CO2), y Microbiológicas (bacterias, hongos y mohos) así como quejas respecto a síntomas clínicos referidos en la literatura especializada para el “síndrome del edificio enfermo” entre los ocupantes del mencionado edificio. Los hallazgos microbiológicos más importantes fueron: Histoplasma capsulatum, Enterobacter sp., E. Coli, Aspergillus fumigatus, Fusarium, en el aire interior del edificio. En cuanto a la presencia de Histoplasma capsulatum es la primera evidencia que se tenga referencia o cuando menos no se ha publicado tal presencia en ambiente urbano. Existe asociación estadísticamente significativa de los síntomas presentados en varios de los pisos y el aislamiento de hongos y bacterias altamente patógenas en el aire que se respira en las oficinas, este estudio nos alerta para implementar medidas para prevenir un problema de salud pública.