Los casos de diarrea relacionada al consumo de mariscos crudos se multiplicaron en Chile cuando llegó la cepa pandémica de Vibrio parahaemolyticus O3:K6. Desde que fue observada por primera vez en la Región de Los Lagos el año 2004, esta cepa proliferó en el litoral llegando a producir más de 8000 casos de diarrea. La proliferación de este clon pandémico de V. parahaemolyticus durante el tiempo que se mantuvo en esta región, ofreció una oportunidad única para estudiar la microevolución que sufrió esta población clonal en su ambiente natural de propagación. Los resultados obtenidos permitieron postular que mediante el estudio de las regiones de DNA repetidas en serie, es posible diferenciar entre aislados clonales de V. parahaemolyticus. Y que es plausible además determinar la microevolución de este patógeno e inferir una posible ruta de su colonización en Chile. Este conocimiento será de utilidad para quienes estén interesados en genética y evolución y adicionalmente permitirá el rastreo de brotes producidos por el clon pandémico de V. parahaemolyticus.