La presente propuesta investigativa busca respaldar la idea de construir un modelo para auditorias de certificación en organizaciones de alta complejidad en Colombia con sistemas de gestión como respuesta a la problemática planteada de cómo evaluar y verificar una organización categorizada como de alta complejidad. En un primer momento, la investigación centró su atención en hacer una exploración teórica del concepto de complejidad en búsqueda de lograr definir con precisión sus características en el contexto organizativo, en ese sentido el documento presenta la información, análisis interpretativos y conclusiones sobre el tema. A partir de la definición estructurada de una organización de alta complejidad, se desarrollaron caminos de revisión fenomenológico alrededor de las experiencias y conocimientos de expertos en de la auditoria. La recopilación de estas percepciones facilitó el reconocimiento de la existencia de problemáticas a la hora de planificar y realizar auditorías a este tipo de organizaciones. Y también fue necesario recopilar e interpretar la percepción de una organización de alta complejidad frente a sus necesidades y expectativas a la hora de ser auditados