El objetivo de esta investigación consiste en la elaboración de un Plan de acción para la Gestión de Alertas Agroclimáticas para sequía agrícola en la Cuenca Hidrográfica del rio San Juan integrándolo al manejo integrado de cuencas hidrográficas y zonas costeras, que vincule el componente de generación y análisis de la información meteorológica, los organismos de vigilancia climática, actores involucrados y la participación de la población. Estas acciones permiten la conformación e implementación de un Sistema de Alerta Temprana en la Cuenca para el peligro sequía agrícola, posibilita la sostenibilidad ambiental del ecosistema. Como resultado obtenido se posibilita la solución a la problemática relacionada con la reducción de la insuficiencia en la integración para la gestión de alertas agroclimáticas para la sequía agrícola empleando la difusión de las alertas a los decisores y población, propiciando la actualización de las medidas a tener en cuenta una vez se establezcan las diferentes fases del Plan de Reducción de Desastres de cada actor involucrado. Esta investigación puede ser aplicable a otras cuencas de interés.