I En la actualidad se sabe que el sistema de cultivo de café tecnificado genera impactos negativos en el medio ambiente; a diferencia del cultivo de café orgánico que incorpora en su manejo árboles de sombra, abonos de origen natural, control biológico de plagas y tecnologías limpias. Adicionalmente, el estudio de quirópteros en la localidad de Aguacate es escaso, desconociendose la composición, estructura y dieta en cafetales bajo diferente sistema de manejo. Se realizaron 20 muestreos durante los meses de septiembre y octubre de 2019, empleando cinco redes de niebla al nivel del sotobosque, que permanecieron abiertas entre las 18:00 y las 6:00 horas. Se capturaron 72 murciélagos pertenecientes a ocho especies. La diversidad mayor se registró en el cafetal orgánico. La especie más abundante fue Artibeus jamaicensis aportando el mayor número de capturas. Los frugívoros fueron el gremio más representado. Se identificaron semillas de los géneros Ficus, Solárium y Piper, de las cuales Ficus fue la más frecuente en las muestras fecales. Se encontraron variaciones considerables en la diversidad biológica y composición de la dieta entre los dos tipos de cafetales.