El Programa de auditoria médica son todos los procedimientos y normas para evaluar la calidad de la atención en salud, como herramienta fundamental en el control asistencial, convirtiéndose en un integrante básico del proceso de la atención de la salud de los pacientes y de la población, cuyo objetivo es monitorear los diferentes procesos de las intervenciones sanitarias plasmadas en la historia clínica, tendiendo a lograr la mayor calidad posible, utilizando estándares o protocolos de atención. Desde el punto de vista teórico, se requiere mejorar el desempeño de la gestión de calidad del sistema de salud, para responder a las necesidades emergentes de la población. Desde el punto de vista práctico, la auditoria médica releva información observando la dinámica del sistema en forma constante, aplica las correcciones a los desvíos en las prestaciones. Desde el punto de vista metodológico, la aplicación de la auditoria proporciona resultados duraderos porque permite modificar la conducta de los prestadores, siendo este el mayor desafío que ha enfrentado esta modalidad de auditoria médica. Desde el punto de vista académico permite a cualquier institución darle un carácter docente.