Colletotrichum lindemuthianum, agente causal de la antracnosis del frijol(Phaseolus vulgaris L.), esta enfermedad presenta una gran diversidad patogénica en todas las regiones productoras de frijol del mundo. En México se han identificado 54 patotipos del hongo. La capacidad de infectar diferentes genotipos de frijol puede variar en las poblaciones del patógeno, debido al establecimiento de nuevas variedades de frijol que ejercen presión de selección sobre ellas. La presente investigación se realizó con el objetivo de caracterizar la variabilidad patotípica de C. lindemuthianum presente en los estados de Oaxaca y San Luis Potosí e identificar fuentes de resistencia contra el patógeno. La identificación de patotipos se llevó a cabo utilizando un grupo doce cultivares diferenciales de frijol y la identificación de fuentes de resistencia se basó en el uso de dos patotipos 64 y 320, que se presentaron en ambos estados. Se identificaron 12 patotipos a partir de quince aislados obtenidos del estado de Oaxaca y 5 de ocho aislados de San Luis Potosí, siete de los cuales (69, 100, 260, 324, 325, 356 y 485) son reportados por primera vez en México.