Debido a las complejas interacciones bioquímicas que ocurren de manera simultánea en un reactor biológico y a los mecanismos de adaptación que manifiestan los microorganismos, su operación y control representa un nicho científico y tecnológico muy vasto, cuyo desarrollo sólo es posible bajo un enfoque multidisciplinario. Desde el punto de vista de su comportamiento dinámico, es conocido que los reactores biológicos exhiben fuertes características no-lineales, tales como multiplicidad de estados de equilibrio, ciclos límite y condiciones de operación inestable, entre otras. Así pues, el análisis formal de su dinámica compleja mediante el uso de los métodos y herramientas para el análisis de campos vectoriales suaves, puede contribuir al mejor entendimiento de estos procesos, así como al diseño de controladores mas eficientes y menos complejos que permitan su adecuada operación a escala piloto e industrial.