Estudios recientes han demostrado que cepas de Bacillus thuringiensis (Bt) aisladas del ecosistema de manglar presentan genes cry novedosos; sin embargo, no existen estudios de caracterización de aislados de Bt en manglares de América. Por este motivo, se estandarizaron las condiciones para la amplificación por PCR de fragmentos de genes que reconocen la familia cry1 utilizando oligonucleótidos generales en 99 cepas nativas aisladas del suelo del ecosistema de manglar de La Ciénaga Grande de Santa Marta, Caribe Colombiano.