La presente investigación analiza el proceso de diseño e implementación de uno de los instrumentos de la política científica y tecnológica en México: los Fondos Sectoriales Constituidos, específicamente trata el caso del Fondo Sectorial de Educación Sep-Conacyt en su convocatoria para Educación Básica durante el periodo 2000 – 2012. Dicho análisis incluye a los participantes, las instituciones y los procesos y tensiones que entran en juego a la hora de formular e implementar la política de Ciencia y Tecnología e Innovación (TCI).Para situar la importancia de los Fondos Sectoriales se esboza una caracterización conceptual de la política científica y tecnológica en el periodo referido y se alude a las formas de conducción de la política a través del concepto de gobernanza y de la teoría del principal -agente. Lo anterior con la intensión de detectar: a) las implicaciones de las “reglas del juego político” en la formulación de la política y b) la calidad de la implementación de las políticas de CTI. En este caso resultó de gran utilidad conceptual y empírica un esquema que tipifica seis características claves de la política: estabilidad, adaptabilidad, coherencia y coordinación, calid