Salmonella spp y E. coli BLEE son bacterias de gran importancia en la salud pública debido a la implicación que tiene tanto en las enfermedades transmitidas por los alimentos como en la resistencia a los antimicrobianos. El objetivo principal de la presente investigación fue aislar Salmonella spp y E. coli BLEE a partir del contenido cecal y ganglios mesentéricos, de cerdos faenados en la EMRAQ-EP y asociar estadísticamente dichos aislamientos con el lugar de procedencia de los cerdos. Se tomaron 365 muestras de ciegos y ganglios mesentéricos en el área de evisceración porcina. Para el análisis microbiológico de Salmonella spp., se empleó la metodología propuesta en la norma ISO 6579, y por otro lado se aplicó la norma ISO 16649 para la determinación de E. coli BLEE. Se obtuvieron en total 56 (15,3%) y 347 (95%) aislamientos de Salmonella spp., y E. coli BLEE, respectivamente. Mediante la prueba de Chi-cuadrado, no se demostró significancia estadística entre la presencia de Salmonella spp., y E. coli BLEE en el contenido cecal y los ganglios mesentéricos, y el sitio geográfico de procedencia de los cerdos muestreados (p>0,05).