La Auditoria Educativa de las instituciones del Ecuador toma en cuenta los estándares de calidad (Ministerio de Educación de la República del Ecuador, 2013), emitidos por el Ministerio de Educación para el proceso de evaluación, se realizó esta investigación para hacer el diseño de un instrumento de evaluación utilizado por los Auditores, específicamente, para evaluar el Proyecto Educativo Institucional (PEI), siendo éste el documento más importante dentro de toda comunidad educativa. Se llega a establecer que estos documentos son elaborados desde planta central del Ministerio de Educación por un grupo de técnicos, éstos instrumentos son confidenciales y utilizados solo por auditores educativos en funciones en el ministerio de educación, por lo cual se procede a diseñar un instrumento evaluador del PEI en base a entrevistas a Directivos y Auditores, a fin de mejorarlo en la última etapa, comprendiendo que para su respectiva elaboración los encargados utilizan un método sistemático – cualitativo los cuales son actualizados cada cierto tiempo, para dar cumplimiento a los estándares de calidad y a los avances que se presentan en materia educativa.