El clavel Dianthus caryophyllus es un componente importante de la floricultura en Colombia. Debido a su importancia comercial, a nivel mundial actualmente se hacen esfuerzos de mejoramiento del clavel que incluyen, entre otros, la producción de nuevas coloraciones florales. El descubrimiento de transposones presentes en genes de regulación o biosíntesis de pigmentos florales como las antocianinas ha despertado gran interés por su uso biotecnológico, es por esto que algunos transposones han sido aislados y se han usado para generar nuevos patrones de coloración en otras especies ornamentales como petunias y boca de dragón. Teniendo en cuenta la importancia y utilidad de los transposones como herramienta para el mejoramiento vegetal, este trabajo se enfocó en analizar seis líneas híbridas de clavel con flores variegadas con el fin de detectar al menos un transposon que se asociara con el fenotipo de flores variegadas para su potencial uso en el futuro en programas de mejoramiento de clavel.