La investigación tuvo lugar en el río El Encano, Humedal Ramsar La Cocha, ecosistema azonal único en Latinoamérica. Carencia de estudios y desconocimiento del manejo, uso y necesidades de la comunidad frente al recurso da pie al objetivo de contribuir a la gestión integral del recurso hídrico, estableciendo escenarios prospectivos, a través de procesos de simulación de calidad de agua; así, se plantearon actividades fundamentales: salidas de campo para diagnóstico de usos, encuestas a la comunidad ribereña para identificar impactos y usos del agua y registro de información para el análisis de resultados; fueron nueve puntos estratégicos de toma de muestras de parámetros fisicoquímicos y se simuló la calidad del agua en el río con la ayuda del software HEC-RAS 4.1. Finalmente, para evaluar el comportamiento del río se plantearon escenarios prospectivos que permiten el análisis integral de los resultados; constituyéndose en herramienta eficaz para estrategias de gestión, ya que los modelos de calidad de agua permiten simular condiciones actuales y futuras, posibilitando estudiar y anticipar las variaciones del río de acuerdo al aumento de la población y de sus necesidades.