El objetivo de este trabajo es la mejora de la comprensión lectora mediante la intervención en morfosintaxis y prosodia. Se diseñaron dos programas (16 sesiones, 45m, 2 veces/semana) con actividades orales y escritas; atención también a aspectos motivacionales. Sesenta y seis niños de 3º de EP divididos en tres grupos, Morfosintaxis, Prosodia y Control, componen la muestra. Se tomaron medidas de inteligencia, memoria de trabajo, ritmo, lectura de palabras, conciencia morfológica, sintáctica y fonológica, nombramiento rápido, prosodia, comprensión lectora y escritura en tres puntos temporales: pre-test, intra-entrenamiento y post-test. Los resultados muestran un efecto positivo del entrenamiento en prosodia, manifestado de forma temprana, y en grupo completo y submuestra de niños con dificultades lectoras. El grupo Prosodia presenta mejoras en comprensión de oraciones, uso de signos de puntuación para comprender el significado, fluidez, expresividad y velocidad de acceso a códigos fonológicos. El entrenamiento en morfosintaxis no muestra la potencia del de prosodia. Se subraya la necesidad de una mayor atención a la prosodia para la mejora de los métodos de instrucción lectora.