Los reactores secuenciales intermitentes basados en lodos granulares son sistemas eficientes y robustos, capaces de soportar fluctuaciones de carga orgánica así como la presencia de compuestos tóxicos. Adicionalmente, los gránulos aerobios presentan una estructura densa y compacta, lo cual permite tener altos niveles de retención de biomasa, así como excelentes propiedades de sedimentación de los lodos, Estas cualidades han permitido colocar a este tipo de sistemas como una alternativa prometedora dentro de las tecnologías de tratamiento de aguas residuales. Sin embargo, se ha reportado que la operación de los reactores granulares se ve afectada por la proliferación de microorganismos filamentosos en la superficie granular. Debido a ello, el presente trabajo se enfoca en el análisis del efecto de la composición del influente y de los tiempos de ayuno sobre la morfología y propiedades estructurales de los gránulos aerobios, tomando siempre como agua residual de estudio las aguas grises, las cuales son consideradas un efluente con un alto potencial de reuso.