En México la actividad de producción de cerdos se encuentra mayormente localizada en el estado de Jalisco el cual aporta casi el 20% de la producción nacional.Por ello es relevante determinar la presencia de problemas ligados a falla reproductiva de origen cromosomico o de salud. Los resultados del presente trabajo muestran la existencia del género “A” de la influenza en las poblaciones estudiadas, también de forma contrastante revela una frecuencia nula del subtipo de influenza AH1N1, lo que indica que este subtipo del virus de la influenza porcina no cuenta con una presencia de consideración dentro dichas explotaciones.Mientras que para la determinación de falla reproductiva se encontró que de 40 sementales de un banco de semen se encontraron 5 sementales con baja fertilidad y reducción del tamaño de camada, no encontrando alteraciones cromosómicas en su genotipo.Para este estudio no se encontraron traslocaciones cromosómicas como causa de falla reproductiva.