El presente trabajo forma parte de un estudio integral que realiza la Comisión Nacional del Agua y la Organización Meteorológica Mundial, el cual permitirá tener un ranking de de los principales tóxicos existentes en la presa el Valsequillo, Puebla. El sistema de clasificación de sustancias contaminantes desarrolladas por el estudio utiliza un sistema multicriterio y toma como base los criterios desarrollados por estudios previos y se complementa con un modelo lineal que nos permite definir un ranking en función a las principales características de las sustancias analizadas. Es necesario tener un sistema de clasificación de contaminantes que brinde información a los usuarios del agua, así como un orden de prioridades en el control de estos contaminantes, siendo este el principal objetivo del estudio. La capacidad de biodegradación de las sustancias es una de los factores determinantes del sistema de clasificación, por lo que se recomienda desarrollar estudios específicos bajo las condiciones climáticas, biológicas y químicas predominantes en México.