En este trabajo se presentan resultados de investigación basada en el desarrollo de competencias de programación integradas al aprendizaje en áreas que tenga mayor dificultad a la enseñanza de la misma, a través del programa Scratch. La metodología utilizada fue cualitativa, y una investigación-acción. La población correspondió a estudiantes de grado quinto, un grupo experimental y un grupo control, la muestra representativa (grupo experimental) fue de 20 estudiantes de este grado cuyas edades oscilan entre los 9 y 10 años. Luego de utilizar Scratch con los estudiantes del grupo experimental, se encontró que mejoraron su desempeño, con un 85% de los estudiantes que aprobaron la prueba final de conocimientos a diferencia del grupo control quienes fueron tan solo el 30% de los estudiantes. Los estudiantes del grupo control no presentaron cambios significativos en su rendimiento. Los resultados revelan que el desempeño académico de los estudiantes en áreas o temas con mayor dificultad, puede mejorar el aprendizaje, posibilitando la asimilación de los conceptos de estas áreas y el desarrollo de competencias utilizando el Software Scratch.