La investigación ecológica se basa en la medición de parámetros de importancia en los organismos, y los factores ambientales con los que estos interactúan. Este proceder, se denomina muestreo. En la mayoría de los casos, resulta imposible medir todos los organismos o las distintas partes del ambiente implicados en un estudio. El muestreo presupone un proceso de selección de organismos o ambientes a medir. La denominada “muestra” ha de representar efectivamente los grupos marinos seleccionados. No obstante, la representatividad del muestreo varía en función del tamaño muestral (número de muestras), y en función de la distribución espacial y temporal de los organismos en estudio. El esfuerzo de muestreo responde a un compromiso entre minimizar el esfuerzo durante la fase de recogida de datos y maximizar la fiabilidad de las conclusiones que se deriven de esos datos. En la presente se sumarizan los principios y procedimientos de muestreo en organismos del bento marino.