El presente documento aborda lo relacionado a la aplicación de la justicia indígena en la comunidad de Quilloac del Cantón Cañar y su compatibilidad con los derechos constitucionales. En su primera parte, se revisa la literatura relacionada a la justicia indígena, su aplicación y como está concebida por los diferentes tratadistas, que explican el sustento histórico, doctrinario y constitucional. Posteriormente se realiza un escrutinio a la población indígena, donde se destaca el grado de conocimiento en la materia por parte de la comunidad indígena y de los diferentes operadores jurídicos del Cantón Cañar. En el ámbito jurídico-constitucional se enfatiza el criterio de los dirigentes indígenas, hasta llegar a identificar las etapas procesales, que guardan relación con el debido proceso como derecho constitucional, con el sustento del derecho consuetudinario, parte consustancial del pluralismo jurídico. Se concluye puntualizando la practicidad de la aplicación de la justicia indígena, con la activa participación de sus miembros, como una herramienta eficaz para resolver sus propios conflictos internos, puntualizando sus ventajas en comparación con la justicia ordinaria.