La evaluación del Sistema de Control Interno por medio de los Manuales de Procedimientos afianzan las fortalezas de la empresa frente a la gestión, por lo que se ha incrementado la necesidad de perfeccionar el Sistema de Control Interno tanto en las organizaciones del ámbito internacional como nacional. En Cuba se establecen normas y principios básicos sobre el control interno en función de lograr que las entidades mejoren sus resultados en cuanto al cumplimiento de sus planes y metas. De lo anterior se deriva el siguiente trabajo, que tiene como objetivo fundamental rediseñar el Manual de Procedimientos para las Cuentas por Pagar de acuerdo a las características actuales de la Universidad de Cienfuegos, por existir ausencia de división de funciones, fijación de responsabilidades y medidas de autocontrol que se deben ejecutar por los funcionarios y técnicos, las cuales tributan al buen funcionamiento. En el desarrollo del trabajo se utilizaron diferentes métodos y técnicas, tales como: el análisis documental, encuestas, cuestionarios, observación así como otros propios de la ciencia.