Las infecciones de origen nosocomial son un problema global de salud pública. Pseudomonas aeruginosa, frecuente agente bacteriano causal de infecciones hospitalarias, posee elementos genómicos como los plásmidos que pueden conferirle ventajas adaptativas. La distinción genómica entre cepas de una especie bacteriana, contribuiría en el diagnóstico y tratamiento de infecciones provocadas por cepas específicas. Para explorar la variabilidad plasmídica en aislamientos de P. aeruginosa de nosocomios en Ciudad Juárez, Chihuahua, México, se determinó el patrón de migración plasmídica en 57 cepas provenientes de 45 muestras de origen clínico. El DNA plasmídico de cada cepa se extrajo por lisis alcalina. El DNA purificado fue separado por electroforesis en geles de agarosa y el patrón de migración plasmídica fue analizado. Se encontró que el 84% de los aislamientos contienen DNA plasmídico, distinguido en 23 patrones de migración, con bandas de 1.5 a ≥13 Kb. Aunque algunas muestras contenían más de un aislamiento de P. aeruginosa y diferentes perfiles de resistencia a antibióticos, no se encontró relación entre el patrón de migración plasmídica y el origen de la muestra clínica.