El agua subterránea en el Estado de Yucatán es altamente vulnerable a la contaminación debido a la naturaleza cárstica del suelo y al vertido de las aguas residuales directamente al manto acuífero, en la mayoría de los casos sin tratamiento alguno, lo cual representa un riesgo a la salud humana y ambiental. El presente trabajo tuvo como objetivos el determinar la variación de la calidad del agua del acuífero de Yucatán del año 2003 al año 2008, en función de los nitratos presentes; así como establecer la calidad bacteriológica del agua subterránea del acuífero del Estado de Yucatán durante los años 2007 y 2008, y determinar el posible origen de la contaminación bacteriológica durante este mismo período.