Para promover el uso del germoplasma de cañahua (Chenopodium pallidicaule Aellen) de Bolivia, se realizó el estudio de su variabilidad genética a partir de la caracterización y evaluación del comportamiento agromorfológico de 744 accesiones. Esta actividad se desarrolló en el Centro Quipaquipani de la Fundación PROINPA (16°40’26.5’’ LS, 68°18’5.76’’ LW y 3881 msnm). Para determinar patrones naturales de variación genética, el grado de discriminación de las variables analizadas y los grupos de diferente variabilidad genética, se aplicaron dos técnicas univariadas y cinco técnicas multivariadas, sobre 17 variables cuantitativas y 7 variables cualitativas. El análisis estadístico descriptivo evidenció una amplia variabilidad genética en cuanto a ciclo fenológico, tamaño de planta, cobertura foliar, rendimientos e índices de cosecha. Las asociaciones establecidas con el análisis de correlación simple, permitieron identificar las variables agromorfológicas que son componentes del rendimiento y que facilitan los procesos de selección.